厦门协议离婚是指夫妻双方就离婚事宜达成协议，经过司法程序审批后达成离婚协议的一种方式。在厦门，协议离婚需要在法院进行办理。
首先，夫妻双方需要就离婚问题达成一致协议，并签署协议书。协议书应包括协议离婚的具体事项，如财产分割、子女抚养等。协议书必须写明双方真实意愿，签字之前应向双方做出明确说明。
其次，夫妻双方需要向当地人民法院提出协议离婚申请书。申请书应包括夫妻的身份证明及协议书，申请书应写明夫妻离婚的原因、离婚的方式以及双方的联系方式。
然后，法院将审核协议离婚协议并组织双方进行审议。双方应及时到场，如有需要，法院将安排调解。如协议合法，法院将对协议进行审批并发出离婚证书，双方按证书上的约定办理离婚手续。
最后，夫妻离婚后还需要办理相关的法律手续，如财产分割、子女抚养等，离婚证书也要到户口所在地的派出所进行登记。
总之，在厦门办理协议离婚需要夫妻双方自行达成协议，向法院提出申请，经过审理和审批后取得法院的离婚证书，并按照证书上的相关规定办理后续的手续。
