协议离婚是指夫妻在不违反相关法律的前提下，通过自愿协商达成离婚协议的方式终止婚姻关系。在协议离婚中，房产归属问题是一个重要的议题。根据我国婚姻法的规定，婚姻期间双方所得所得的财产应当共同财产，应当同等分配，就算该财产只是某一方所得，另一方也应当得到相应的补偿。
因此，如果双方通过协议离婚，想要将房产归子女所有，就需要考虑以下两种情况：
第一种情况是该房产是夫妻共同财产。在这种情况下，夫妻双方应当共同分割该房产，各自得到相应的份额。如果双方协商，其中一方放弃对房产的分割权，然后将该房产作为赠与或者遗产留给子女，这样的协议需要经过公证并且具有法律效力。但是即使这样协议达成，如果对方随后反悔，法律仍然会以房产共同财产的原则进行分割。
第二种情况是该房产是某一方所得，但是另一方在婚姻期间给予了相应的贡献。在这种情况下，对方也应当得到相应的补偿。如果协议离婚时，双方达成一致，同意将房产作为赠与或者遗产留给子女，这种协议也需要经过公证并且具有法律效力，但是在这种情况下，如果对方随后要求分割房产，法律也会支持他们的请求。
综上所述，即使是协议离婚，房产归属问题依然需要遵循法律的规定。如果房产是夫妻共同财产，双方需要共同分割，并且双方有平等的权利和责任。如果双方想要将房产归子女所有，需要遵循法律规定并获得公证，否则法律将支持被剥夺权益的一方。
