如果已经提交了离婚协议并申请了补偿，但是在之后想要撤消补偿申请，需要采取以下步骤：
1.与对方协商：首先需要与对方进行沟通和协商，了解对方的立场和是否同意撤消补偿申请。如果对方同意，可以修改协议并重新提交。
2.申请撤销：如果对方不同意，需要向法院提交书面申请，说明撤销补偿申请的原因和理由，并提供相关证据。
3.等待审批：法院会对申请进行审批，并根据实际情况做出判断。如果法院认为撤销补偿申请符合法律规定和公平原则，就会批准撤销。
4.重新协商：如果撤销补偿申请成功，需要重新与对方协商协议的内容，并进行修改和重新签署。同时要尽可能地保证协议的合法性和公正性，避免后续出现纠纷和争议。
总之，撤销离婚协议的补偿申请不是一件容易的事情，需要进行充分的沟通和协商，并且需要遵守法律程序和原则。如果有需要，建议寻求专业律师或法律机构的帮助和指导，以确保自己的权益得到有效保障。
