协议离婚对银行存款的算法是根据当事人达成的离婚协议来确定的。在协议离婚中，夫妻双方需要协商划分财产，包括银行存款在内。一般来说，夫妻双方共同拥有的银行存款应该平分，然而也有特殊情况。如果某一方对家庭财产的贡献或付出不足，或者存在债务等其他特殊情况，可以根据具体情况进行更加合理的分配。
如果双方没有达成协议，根据我国现行的《婚姻法》的有关规定，离婚后的夫妻共同财产应该由双方自行协商分配，若协商不成，将由法院根据事实和法律规定进行裁决。在法律规定的基础上，法院会考虑夫妻双方在婚姻中的贡献以及经济实力等方面的因素，进行公平、合理的财产分配。
总之，协议离婚对银行存款的算法主要依据夫妻双方的协议来确定，如果协议不成，根据《婚姻法》的规定进行公平、合理的财产划分。离婚是一件比较麻烦的事情，一定要谨慎处理，秉持公平合理原则，避免给自己和对方造成不必要的损失。
