武汉拆迁协议如何退税，需要根据不同情况具体分析。
首先，需要明确的是，根据我国税收政策规定，拆迁补偿款、安置补助款等不属于应纳税所得，因此不需要为其缴纳个人所得税。但是，在实际执行过程中，可能存在相关规定的执行不到位等情况。如果属于需要缴纳个人所得税的情况，应按照规定缴纳个人所得税，不得作为免征、减免税款。
其次，如确实存在需要退税的情况，需要遵循以下几个步骤：
1.核实退税资格：需要确定自己的纳税记录、退税资格以及退税金额等相关信息，确保自己符合退税资格，并核实相关退税金额。
2.办理退税申请：根据税务部门的规定，需要提供相关资料，例如纳税人的居民身份证、银行卡等，填写《个人所得税退税申请表》，并向税务部门提出退税申请。
3.等待审核：等待税务部门对退税申请进行审核，审核通过后，将直接将退税金额打入纳税人的指定银行账户。
总之，对于武汉拆迁协议如何退税，应根据相关具体情况进行分析，如有需要，请咨询相关税务机关。
