协议离婚是指夫妻双方在自愿、平等、协商的基础上达成离婚意愿并签署了协议书，在协议书中明确解决了关于子女抚养、财产分割等方面的问题。因此，一般情况下法院会受理协议离婚申请，但也有一些特殊情况下法院可能会不受理协议离婚申请。
首先，夫妻双方不具备离婚的资格，则会不受理协议离婚申请。具体来说，夫妻一方或双方未年满22周岁或者未满1年的婚姻关系、一方或双方系直系血亲或三代以内旁系血亲、一方或双方有配偶或有恋爱或者同居关系的都不具备离婚的资格，此时法院会不予受理协议离婚申请。
其次，协议离婚存在违法情况，则不予受理。例如，夫妻一方或双方通过财产转移等手段逃避债务或债权的情况，一方或双方在签署协议书时存在欺诈、胁迫等情况，这些都会导致协议离婚申请不受理。
再者，协议离婚涉及到未成年子女抚养的问题，则法院有可能不受理。未成年子女的抚养问题涉及到子女的生活、教育和健康，这些都需要法院审慎处理，因此，在未成年子女的抚养问题上，法院对协议离婚申请的审慎程度会更高。
综上所述，协议离婚在大部分情况下都会被法院受理，但在以上特殊情况下，协议离婚申请有可能会被法院不予受理。因此，在协议离婚申请的过程中，夫妻双方需要认真了解相关的法律规定，并严格按照法律程序和要求办理离婚手续。
