拆迁协议补办确实会带来一些麻烦，但这取决于情况的复杂程度和当事人的态度。下面是一些可能出现的问题和应对措施：
1. 时间成本增加：补办拆迁协议需要重新安排双方的时间，完成协议的签订及相关手续，可能需要额外的办理时间和工作量。此时，建议做好时间安排，确保各方时间的充分利用。
2. 法律问题：因为签订拆迁协议是一项法律行为，重新办理时可以遇到一些法律问题。例如，当事人之间的利益分配、拆迁方案的变更、土地所有权等问题。此时，建议寻求专业法律帮助，确保双方的合法权益得到保障。
3. 资源调配：重新办理拆迁协议可能涉及到不同部门的共同配合，需要资源的协调调配。例如，房管局、财政部门等。此时，建议充分沟通协调，避免资源浪费和拖延时间。
4. 交通摆阔：许多拆迁地点交通比较拥堵，所以在签订拆迁协议时，需要安排足够的交通时间，确保双方都能准时到达，并顺利完成补办。
总之，补办拆迁协议可能会带来一定的麻烦和成本，但如果双方充分沟通，合理协调，寻求专业帮助并做好充分准备，相信可以顺利完成。
