分居协议是夫妻在分居期间规定双方在婚姻关系不确定期间各自的权利和义务的协议。事实上，分居协议并不能作为离婚证，因为在法律上离婚证是指离婚判决书或离婚调解书。
当夫妻关系出现问题，你可以先与你的伴侣达成分居协议，对于夫妻关系的中断，分居协议可以起到一定的作用。但分居协议并不能替代离婚证的作用。如果你想以分居协议上的内容作为掌握权利和义务的证据，可以在分居协议中加入一个陈述，说明如果将来双方达成离婚的协议，分居协议中的惯例将成为离婚协议条款的一部分。当然，在法律上这种协议仍不是离婚证，只能起到用于证明双方意见一致的作用。
因此，如果双方经过长时间的考虑和协商决定离婚，最好的做法是到司法机关申请离婚，并且法院会颁发离婚证。这样的离婚证可以证明婚姻的有效终止，并且权威性很强。
总之，分居协议不能取代离婚证，但它可以作为离婚协议的一部分，用于证明双方的意见，从而在离婚协调过程中，更容易达成协议，进而达成离婚。这种协议规定的内容也可以与离婚协议的条款相似，从而最终证明双方意见一致。
