更改抚养权协议需要在法院进行处理，具体操作步骤如下：
1.申请变更抚养权协议的一方需要先收集相关证据，包括孩子的健康状况、生活环境、教育发展情况等，以及双方的收入情况、工作时间等。
2.根据收集到的证据，编写一份详细的变更申请书，并在申请书中充分陈述自己的诉求和原因，以便法院更好地理解你的情况。
3.提交申请书和相关证据到当地法院，并按照法院的要求缴纳相关费用。
4.法院将召开庭审，双方需要出庭作证，法院根据当事人的陈述和证据调查，最终做出变更抚养权协议的判决。
需要注意的是，申请变更抚养权协议的一方必须证明原协议已经不能保障孩子的利益，否则法院不会轻易做出变更的判决。申请变更的过程需要一定的时间和成本，建议在考虑决定前与一位专业律师咨询。
