离婚协议档案局是公安机关和民政部门收集、存放离婚协议文件的机构。离婚协议是一种可以调解离婚纠纷的法律文书，存证于该局可以确保离婚协议的法律效力。但是，离婚协议局并没有存放严格的“存根”，而是存放离婚协议原件或副本。以下是对离婚协议档案局的详细解释：
首先，离婚协议局存储离婚协议原件或副本，但是并不是所有离婚协议都需要存储。只有在协议达成之后，法律工作人员与双方当事人对协议内容进行确认之后，才会将档案存入局中。而且，只有当离婚协议被双方当事人签字盖章，并经过法律工作人员确认后，才会被存储。
其次，离婚协议局并没有存放严格的“存根”一说。在存放离婚协议文件时，将文件原件或副本的一份留存局内，作为备案存储。同时，另一份交由当事人领取，并保留在其个人档案中。这样，一旦出现协议内容纠纷，法律工作人员可以及时查阅双方当事人互换的文件，确保协议内容的准确性。
第三，离婚协议局的存储工作严格遵守机密性原则。对于存放的离婚协议原件或副本，未经事先授权，任何人都无权查阅和复印。同时，进入档案室的人员必须出示有效的身份证明和权利证明，才能进入档案室查询或取阅文件。这样一来，离婚协议的内容不会被泄漏或被不当使用。
综上所述，离婚协议档案局是一个非常重要的机构，用于保障离婚协议的合法性和有效性。虽然其没有存放严格的“存根”，但是这并不影响其为离婚当事人服务的重要性，同时也能够确保离婚协议的机密性和保密性。
