是的，协议离婚可以在东莞办理。
根据《中华人民共和国婚姻法》和相关法规，对于没有纠纷或者纠纷得以解决的夫妻，可以通过协议方式办理离婚手续。协议离婚需要夫妻双方自愿提出离婚，协商好涉及到财产、孩子抚养、赡养等问题，并签署离婚协议书。经过当地民政部门证明认可后，即可生效。
在东莞，协议离婚需要到当地的民政部门进行办理。具体流程为：夫妻双方到当地民政部门办理离婚登记，提供相关证明材料和协议书。民政部门会审核协议是否合法并进行公证，然后将公证书颁发给申请人。
协议离婚的好处是可以避免繁琐的诉讼程序和命令制约，对双方都有利。但需要注意的是，协议离婚的协议书需经过双方真实意愿确认和民政部门公证，协议书内容不能违反法律规定，否则离婚无法生效。
总之，在东莞办理协议离婚较为便捷，但需要夫妻双方认真协商，仔细阅读离婚协议书，确保离婚协议合法有效，以免出现后续问题。
