协议离婚的单位是否能知道主要取决于离婚双方的职业和单位政策。
对于一些单位来说，员工离婚是个人隐私，单位不会过多干涉。但是对于一些如国企、政府机关等单位，离婚的信息是需要上报的，因为这些单位对员工的私人生活较为关注，离婚对员工的工作表现可能会有一定影响。
此外，对于离婚双方其中有一方是在单位内任职的，单位可能会依据相关法律法规及制度规定要求离婚双方提供离婚证明、协议离婚协议书、抚养协议等相关材料，以更好地维护双方与单位的关系。
但是在实际操作中，单位是否能知道双方的协议离婚，还因双方的态度和方法而异，如果了解和掌握好协议离婚的相关法律法规，不放过任何细节，就可以有效地保护自己的隐私权和合法权益，避免纠纷的产生。同时，协议离婚也需要双方互相配合，不泄露对方隐私，共同落实好协议离婚的各项条款，以避免对双方的生活和工作造成不必要的影响。
因此，对于协议离婚的双方来说，及时了解单位的相关政策，妥善处理好个人的隐私信息，保护好自己的合法权益是至关重要的。
