分居协议在离婚诉讼中具有一定的法律效力，但并不代表它就可以完全替代法院的裁定。如果双方已经签署了分居协议，通常情况下法院会尊重双方的协议，但必须符合以下条件：
首先，分居协议必须是自愿签署的，不能存在侵犯一方权益的行为；其次，分居协议必须具有法律效力，即协议内容应在法律上得到认可；最后，分居协议必须符合公序良俗和社会道德准则。
如果分居协议违反了上述任何一项条件，法院将不会认可该协议并会进行裁决。此外，如果某一方在诉讼时提出了分居协议的异议，法院很可能会进行独立审查，判断该协议是否有法律效力和是否符合公序良俗和社会道德准则。
总之，分居协议在离婚诉讼中可以作为参考依据，但不能完全取代法院的裁决，更不能代表合法。离婚诉讼中，应该尊重法律途径，遵守相关规定，确保合法性和公正性。
