变更抚养权后协议是否还生效，取决于变更抚养权的具体情况以及协议的条款。
如果变更抚养权是经过法院裁决或者经过协议双方重新签署协议达成的，那么协议就不再生效。因为变更抚养权的裁决或者重新协商协议已经取代了先前的协议，并成为双方新的法律约束。
但是，如果变更抚养权的具体情况只是协议双方自愿达成了协议，那么协议仍然有效。例如，父母原本的协议是孩子归母亲抚养，但随着时间的推移，双方都认为孩子应该归父亲抚养，这时候父母可以自愿达成新的协议，将抚养权转移给父亲。此时，原先的协议仍然生效，只是被新的协议所替换。
需要注意的是，协议的变更一定要按照法律程序并在法律的监督下进行。如果双方私下协商并未经过法律程序，那么相关协议是不具备法律效力的。
总之，变更抚养权后协议是否仍然生效，取决于变更抚养权的具体情况以及协议的条款。必要时，咨询专业律师可以帮助双方了解相关法律程序和条款。
