拆迁协议契税是指在拆迁过程中，按照国家有关规定，产生的土地使用权转移所需要的税费。它的计算方式与普通的房地产交易契税有所不同，需要根据不同的情况进行计算。
首先，要根据拆迁协议的内容和具体情况来确定契税的计算基数。一般来说，拆迁协议根据拟建项目的不同，会有不同的标准，比如按照现有房产估值、按照实际面积计算等。
然后，要确定契税税率。根据国家有关规定，拆迁协议契税的费率在1%—5%之间，具体费率还要分地区而定。例如，一些经济发达省市的税率会相对较高，而中西部地区则会相对较低。
最后，计算契税的具体金额，即根据所确定的计算基数和税率来计算。例如，假设某城市拆迁协议契税税率为3%，拆迁协议的计算基数为100万元，那么所需要缴纳的契税就是100万元*3%=3万元。
需要注意的是，拆迁协议契税需要在合同签订后的30天内缴纳，否则会被视为未付款，拖欠拆迁契税将会带来相应的法律后果。因此，在拆迁过程中，缴纳契税是非常重要和必要的一项操作。
总之，拆迁协议契税的计算需要根据具体情况来调整计算基数和税率，只有对契税的计算方法有所掌握，才能确保在拆迁过程中的合法权益。
