如果协议离婚五年后，其中一方起诉离婚，需要按照相关法律规定，进行诉讼程序。
首先，需要提交离婚申请书以及相关证明材料，如身份证、婚姻证明、协议离婚协议书、结婚登记证等。申请人应该明确表明自己的诉讼请求和主张，即希望法院做出怎样的离婚判决，以及离婚财产的分配等。
同时，被诉方要进行答辩，声明是否同意离婚并作出自己的处理意见。
在开庭审理过程中，法院将依据双方提供的证据，如结婚证、协议离婚协议书等，进行审理。如果需要进一步了解双方当事人的情况，法院可能会直接约谈当事人或通过其他渠道调查取证。
在判决离婚案件时，法院将综合考虑协议离婚协议书及其他证据，结合法律规定和事实情况，做出离婚、财产分割和抚养子女等方面的判决。
总之，协议离婚五年后仍可起诉离婚，但需要依据法律程序进行诉讼，并在法院的裁判下做出判决，才能最终解决离婚及财产分割等问题。
