根据目前中国的现行法律规定，全国各地的人民法院都有权审理离婚案件，因此深圳可以办理异地协议离婚。但是在办理异地协议离婚时，需要注意以下几点：
首先，离婚协议书必须合法有效。离婚协议书应当明确离婚的协议内容，如财产、子女抚养等事项，协议双方应当自愿签署，没有一方被迫或者欺诈的情况存在。
其次，需要选择合适的审理法院。异地协议离婚一般选择离婚双方户籍所在地的人民法院，但如果双方都在外地工作、生活，也可以选择双方共同协商同意的审理地。
最后，应当遵守法定程序进行申请。离婚协议双方需要到当地的民政局进行申请，并提交相应的申请材料，如身份证、结婚证等。经过审查后，民政局将发放结婚证注销证明，随后提交到当地的人民法院进行离婚登记。
在办理异地协议离婚时，离婚双方应当了解相关法律法规的规定，遵守法定程序，尽可能减少不必要的纷争和误解，确保离婚过程的顺利进行。
