是的，法院有权取消协议离婚约定。虽然协议离婚是夫妻自愿协商，达成离婚协议并提交给法院审批，但各种原因可能导致协议离婚无法执行或出现问题，需要法院介入解决。
以下是几种情况下，法院有权取消协议离婚约定：
1. 离婚协议违反法律规定。夫妻因各种原因签订了不合法、不合规的协议离婚，如规定夫妻财产分割方式不合法，协议离婚内容涉嫌合同违法等，法院有权拒绝审判此协议。
2. 离婚协议与当事人真实意愿不符。协议离婚是由夫妻自愿协商达成的协议，如果协议内容严重损害当事人利益、有明显违反原则的情况下，法院可以取消协议离婚约定。
3. 离婚协议存在重大漏洞。协议离婚内容中存在漏洞、不完整等情况，法院认为这些漏洞会给双方当事人带来严重的法律后果，也可以取消协议离婚约定。
4. 离婚协议不符合公序良俗。离婚协议中，如规定抚养权分配以及财产分配，若涉及不符合社会道德、公序良俗的情况，法院也有权拒绝审判此协议。
综上所述，法院可以取消协议离婚约定，但必须事先进行审判确认。当然，在协议离婚签订过程中，夫妻双方应该联系律师参与阅读协议内容，确保协议符合法律法规，并能够执行。
