协议房拆迁是指建筑物依法未取得建设用地批准文件，未经过规划审核，属于非法建筑的房屋，由政府采取补偿或强制拆除等方式进行整治。
对于协议房拆迁，根据相关的法规和地方政策，是按照一定的标准进行补偿的。此外，协议房拆迁的补偿金额还需参考当地市场价格、用地政策等因素计算，并且有关部门将在拆迁前开展评估工作，评定合理的补偿标准，从而确保被拆迁人的合法权益不受侵犯。
一般协议房拆迁的补偿标准包括以下部分：
1. 产权补偿费：包括安置房面积与房屋原价差额等费用。
2. 劳动力补偿费：包括拆迁户原工作的失业费用、再就业的培训费用等。
3. 过渡期租金补偿费：包括拆迁户过渡期间的居住租金等费用。
4. 临时生活补助费：包括拆迁户短期内生活的资金补助等。
5. 其他费用：包括拆迁户房屋装修等费用。
同时，一些地方还采取了一些特殊的补偿政策，如将被拆迁户选定的新房交纳一定的首付款、考虑被拆迁户是否有不动产证等等，从而最大程度地保护被拆迁户的权益，确保对被拆迁户的补偿是公平、合理、透明的。
总之，协议房拆迁的补偿标准是比较复杂的，涉及到多个方面。政府部门应当严格按照相关法律法规和地方政策，为被拆迁户提供合适的补偿，尽最大努力保护被拆迁户的合法权益。
