经过法院协议离婚是一种常见的离婚方式，其实效性是有保障的。首先，经由法院调解达成协议的离婚，对夫妻双方都进行了深思熟虑，各方面的利益都得到了充分地考虑，协议的方案也经过双方的认可和签署，因此可以保证其有效性。
其次，法院协议离婚在程序上也有明确的法律规定和相应程序的操作。在离婚协议达成后，需将离婚协议报送相关的法院进行审批。如果法院审查认为协议没有违反相关法律规定，离婚方案符合民事法律的相关规定，那么就会判决离婚协议生效，夫妻双方就可以按照协议约定的方式进行离婚处理。
最后，法院协议离婚也在法律上获得了保障。《中华人民共和国婚姻法》规定：“夫妻双方一致要求离婚的，人民法院应当准予。”也就是说，只要夫妻双方一致提出离婚申请，即使是协议离婚，法院也会依据其法定职责依法判决离婚，这保证了协议离婚的合法性和有效性。
综上所述，经过法院协议离婚是一种有效的离婚方式，其合法性、程序的严谨性以及法律的保障都能够有效地保证夫妻双方的利益。
