农村宅基地产权模糊的原因有多种。首先，农村宅基地的使用权和所有权在法律规定上是明确的，但由于历史原因和地方习惯法律法规的执行不够严格，宅基地的产权往往被弱化或模糊化。
其次，政府调整土地用途时的裁量权也可能导致宅基地产权模糊。政府可以通过对土地的规划调整来改变宅基地的用途，如果宅基地被划为工业用地、集体经营性建设用地等，那么宅基地的产权也会受到影响。
此外，一些村民为了避免征收等政府行为，将宅基地转让给私人或企业，导致宅基地的产权进一步模糊。而在这种情况下，新的所有人或企业往往缺乏对土地的确权和登记，也会带来更多的法律纠纷。
最后，由于农村宅基地的分配和管理存在较多的随意性和不确定性，加之基础设施建设缺乏完善，很多宅基地都面临着流转和闲置的问题，从而使得宅基地的产权更加模糊不清。
因此，加强对农村宅基地法律制度的落实和完善，加强对宅基地的监管和管理，保障村民合法享有土地的产权，才是解决农村宅基地产权模糊问题的根本出路。
