协议离婚是夫妻通过协商达成的离婚方式，其分配财产的方式是夫妻双方协商一致并经过公证确认后执行。如果在协议离婚中，夫妻共同所有的房产需要进行分配，那么如何申请房产证呢？
首先，夫妻双方需要在协议离婚协议书中写明是谁保留该房产，如果该房产需要转移至其中一方名下，那么需要办理房屋产权过户手续。具体步骤如下：
1. 房屋权属确认
协议离婚中，房产的所有权归属双方夫妻共同所有，需要确认哪一方要继续保留该房产。同时，如果还有其他共同所有的房产，也需要进行分配协商。
2. 法律公证
协议离婚协议书需要在公证处进行公证。公证录入系统后，会生成“离婚协议公证书”，并注明房产分配的内容。
3. 提交申请材料
将协议书和离婚协议公证书等相关材料，一并提交到房产所在地的房地产管理部门，申请房屋产权过户手续。
4. 费用缴纳
申请过户需要缴纳一定的过户费用，根据当地规定进行缴费。
5. 审核过户
房产局会对提供的材料进行审核，如果符合相关规定，就会进行房屋产权过户，并重新办理新的房产证。
总体来说，在协议离婚中分配共同所有的房产需要进行公证和过户手续，并支付一定的费用。夫妻双方需要仔细协商，并根据实际情况进行分配，然后按照规定程序去办理。
