山东省农村宅基地的证书主要有三种：宅基地承包经营权证书、宅基地证和宅基地使用证。
首先，宅基地承包经营权证书是宅基地的核心证件，它是宅基地农户行使宅基地所有权的必要证件，是宅基地最基本的权利凭证。宅基地承包经营权证书一般由农村土地管理部门发放，宅基地农户办理宅基地使用手续时需要提供宅基地承包经营权证书。
其次，宅基地证是宅基地的产权证书，是宅基地农户持有的重要证件，宅基地证上面还会注明宅基地的地理位置，因此在买卖、转让宅基地时也是必不可少的。
最后，宅基地使用证是宅基地农户在土地管理部门办理宅基地改建或者拆迁补偿时需要提供的证件，也是宅基地农户在宅基地上移建房屋的必备证明。此外，根据当地的管理模式和权益保障政策，还可能涉及到其他类型的证明文件，如家庭住房证、拆迁补偿协议和土地征收补偿协议等。
综上所述，山东省农村宅基地的证书种类繁多，农户需要根据自己的实际情况选择具体的证明文件，以确保自己在宅基地管理中的合法权益不被侵害。
