协议离婚是配偶之间经过协商，达成离婚协议，不需要经过司法审判的一种离婚方式。在协议离婚中，夫妻双方需要协商财产分配，包括共同财产和个人财产。对于协议离婚的公司分配，一般是可协商的。
在确定公司分配的过程中，需要考虑以下几个因素：
1. 公司的性质和价值：公司的性质和价值是影响分配比例的重要因素。如果公司是共同创立的，夫妻双方应该根据各自的贡献、经营能力等进行公平分配；如果是一方单独创立的公司，另一方应该得到适当补偿。
2. 双方的家庭角色和收入：如果一方在家全职照顾子女，另一方则全职工作赚钱，那么财产分配时要考虑到双方的收入差距以及非货币贡献，应该给予一定的补偿。
3. 协议的公平性和合理性：协议的公平性和合理性是协议离婚的前提，双方应当认真协商，合理地分配夫妻共同财产和个人财产，并确保协议符合法律规定，并且双方都能够接受。
在协议离婚的分配中，双方可以根据具体实际情况来制定协议，符合意愿即可。不过需要注意的是，如果协议过于不公平不合理，或者触犯了法律规定，一方或双方都可以在离婚后提出重新分配财产的诉讼。因此，离婚夫妻之间应该尽可能地坦诚沟通，建立互信关系，在尊重彼此的基础上制定公平合理的财产分配方案，避免引发不必要的矛盾和纠纷。
