在中国，第二次申请协议离婚的时间取决于当地法院的工作效率。根据《中华人民共和国婚姻法》规定，夫妻双方自愿离婚可以向当地人民法院申请离婚，但是需要经过一个磨合期，这个期限是6个月。如果在磨合期内夫妻双方感情依旧没有改变，可以再次向法院提出离婚申请。
如果第二次申请协议离婚，同样需要经过磨合期的时间，这是法律规定的时间，必须要等待。在这段时间内，夫妻双方可以进行沟通和妥协，寻求改善感情的方法。如果在这段时间内夫妻双方再次申请离婚，法院会认真审核，尽快作出裁决。
通常情况下，在正常情况下，第二次申请协议离婚的时间一般不会太长，因为法院往往会尽快作出判决，以便让夫妻双方早日解脱。如果在第二次磨合期内夫妻双方的感情依旧没有改善，离婚程序也会比较顺利，时间不会太久。
总之，在进行第二次申请协议离婚时，夫妻双方需要耐心等待一段时间，同时也要尽可能的进行和解和妥协，以便顺利离婚，摆脱不快的婚姻关系。
