如果已经签署离婚协议，房产证的所有权归属问题也应该在协议中得到明确，具体应该如何执行需要根据当事人签署的离婚协议来具体分析：
1. 如果协议中约定了房产归属问题，那么根据协议所规定的，可以办理房产证的过户手续。需要注意的是，在办理过户手续时，需要双方一同到场办理，如果对方不愿前来办理，可以由你委托律师通过法律途径来处理。
2. 如果在协议中没有对房产归属做出明确规定的，应该根据相应法律法规的规定来处理。如按照法定的离婚财产分割规定，可以将夫妻共同所有的房产等其他财产按照法定比例进行分割。
3. 在办理房产证过户手续时，如果遇到对方不同意或者拖延时间等情况，建议及时咨询律师或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
总之，在离婚后处理房产证归属问题，最关键是要根据协议约定或者法律规定，合理有序地按照程序来处理，保障自己的合法权益。
