离婚协议是离婚双方达成一致意见后签署的合法文件，最终确定双方离婚后各自的财产和责任。存在公司财产的情况下，离婚协议的有效性对双方的利益至关重要。
首先，在协议中明确公司的性质和所有权归属。如果公司是双方共同经营的夫妻联合企业，协议应该规定清楚双方在公司的权益份额。如果公司是由其中一方经营所有的个人企业，协议应该体现该企业的所有权归属情况。
其次，协议需要规定双方对公司的控制方式。如果一个人持有大部分的公司股份，那么该人将掌控公司的决策，此时需要协议规定明确的审批程序和授权权限。否则，将可能导致一方在决策层面完全失去话语权，影响公司的正常经营，损害投资价值和公平性。
另外，在公司价值上涨期间，协议应该明确确定“分赃”原则，双方基于公司股权份额分配收益的比例，这就可以避免离婚后判决分配产生的不公平情况。协议还需要指定在公司被卖掉或合并时的分配原则等相关细节。
最后，离婚协议必须由双方自愿签署，签名前必须经过法律顾问或律师的审核和确认。对于公司财产仲裁、法律诉讼等产生的一些纠纷，双方也应该在协议中约定明确的解决方式和程序。只有以这种合法和公平的方式达成离婚协议，才能保证协议的真实可行性和有效性。
