根据《中华人民共和国物权法》第十条：宅基地使用权属于集体所有，但可以依法转让或者出租。而且《宅基地条例》第十一条也规定：宅基地应当属于村集体所有，可以村集体组织出租、转让或者以其他方式利用。
因此，从法律的角度来看，法院是有权拍卖农村宅基地的。当然，在执行过程中，需要遵循相关法律规定和程序，确保程序合法，保护农村宅基地使用权的合法性和正当性。
在具体执行中，法院可以根据判决文书的要求，对拍卖的宅基地进行公示、竞价、成交等程序，以确保拍卖操作合法、公正，保护各方合法权益。
总之，法院在执行程序中，有权拍卖农村宅基地，但必须依法进行，并且保护宅基地使用权的合法性和正当性。
