如果在协议离婚时发现了对方有外遇，这可能会对离婚协议的制定产生一些影响。首先，你需要确定离婚协议是否已经签署，如果协议已经签署，那么协议中约定的离婚条件和分配财产的条款将成为法律效力。
如果发现对方有外遇，你可以尝试与对方协商并协商关于离婚协议的修改，特别是关于财产分配、抚养子女和赡养老人等方面的部分。如果你和你的配偶可以就这些问题达成一致，那么可以修改协议并再次签署，以更新新的离婚协议。
如果无法协商一致并更新离婚协议，则可能需要在法庭上解决问题。如果你可以证明你的配偶的不忠行为，那么这可能会影响财产分配、抚养子女和赡养老人等方面的决策，法庭可能会更加倾向于支持你的要求。
需要注意的是，完全依赖这些非正式的形式，如协商和调解来解决离婚带来的问题是比较危险的选择。因此，请寻求专业律师的帮助以确保你的权益得到合法保障，并在离婚协议中纳入防范外遇的条款，以防止未来某种情况发生时添麻烦。
