协议离婚时，夫妻双方需要就财产分割达成一致意见。对于已有公司，分割方式主要有以下几种：
1. 共同经营：如果夫妻双方愿意并有能力共同经营公司，可以保持原有公司不变，继续进行合作经营。
2. 出售分割：夫妻双方可以协商出售公司，将分得的金额按指定比例分配给双方。这种方式对于公司不景气或双方对公司没信心的情况比较合适。
3. 财产分割：根据夫妻双方共同协商，按照公司估值和双方出资比例，划分双方的股份或资产。一般是根据公司估值具体分得的股份或资产。
4. 一个人放弃：一方可以放弃对公司的所有权或管理权，不再参与公司运营，由另一方拥有该公司，并负责公司的经营管理。
总之，在协议离婚中，夫妻双方可以根据实际情况和个人意愿，在各种可行的方案之间进行选择，以达成双方满意的财产分割方案。要了解公司如何分割，需要咨询专业的律师或财务顾问，并对财务资产做详细审查，以确保财产分割的公平合理。
