农村宅基地加工厂是否违法，需要分情况讨论。在中国，土地所有权属于国家，而在城乡规划中，宅基地是国家为保障农民住房权益而规划的土地使用方式。宅基地所有权归农民所有，但土地使用权则需经过国家有关部门的批准。
如果农村宅基地加工厂在获得土地使用权的许可后，按照规定进行建设、排污、用电等，并且符合环保、消防、安全等相关规定，那么在技术层面是合法的。但是，在具体实践中，很多农村宅基地加工厂并没有获得建设许可，存在不合法建设的可能。
此外，在发展乡村经济的过程中，农村宅基地加工厂也存在一些潜在的问题。比如：
1. 污染，某些宅基地加工厂采用落后的技术，可能会对土壤、空气和水资源造成污染，影响当地环境和居民的健康安全。
2. 噪音，某些宅基地加工厂的生产活动会产生很大的噪音，会扰民影响居民的正常生活，需要注意噪音治理。
3. 安全问题，一些宅基地加工厂在安全意识方面欠缺，存在火灾、爆炸等安全隐患，需要加强安全管理。
因此，农村宅基地加工厂的是否合法，应该在符合土地利用规划和环保、消防、安全等有关规定前提下进行。而为了促进农村经济的发展，相关部门也应该加强对农村宅基地加工厂的规范管理，切实保障当地居民和环境的权益。
