离婚是夫妻双方通过法律手段，解除婚姻关系的过程。根据我国婚姻法规定，如果夫妻双方都同意离婚，可以通过协议离婚来实现。
不过，对于孩子只有三个月的家庭而言，离婚会对孩子造成非常大的影响，因此必须非常慎重地考虑。首先，父母双方应该认真考虑与孩子的关系，并确定如何维护孩子的福利、成长和发展，确保离婚不会对孩子的身心健康带来不利影响。
其次，父母双方应该协商好孩子的抚养、监护、教育和财产等各个方面的事项，并将协议内容写入离婚协议书，双方共同签字确认。同时，如果孩子有特殊需要，例如需要医疗照顾或必须接受特殊的教育，则应该在离婚协议书中特别注明，并考虑给予额外的支持和保障。
最后，为了保护孩子的权益，父母双方还需要在协议离婚之前向当地有关部门提交孩子的生育证明、户口簿、出生证明和相关财产证明等证明材料，以确保离婚协议的合法性。此外，如果协议离婚涉及财产分割问题，双方还应该请律师参与，协助解决纠纷并保障自己的合法权益。
总之，三个月大的孩子协议离婚需要父母双方充分考虑孩子的福利和权益，进行妥善协商，确保离婚协议的合法性和可执行性，以免对孩子造成长期不良影响。
