在孩子三个月的情况下，协议离婚是最为理智、和平的选择，避免对孩子的成长和家庭状况产生更大的负面影响。
首先，双方应该保持冷静，理性分析，明确表态，提出自己的离婚意愿，并通过非正式渠道进行了解和协商。协议离婚主要分三个方面：子女抚养权、财产分配和债务承担。
对于子女抚养权，双方应该根据孩子的实际情况，协商出一个公平、合理的方案，并尽可能保证孩子的利益和幸福。可以考虑将抚养权分时段共同照顾，或由一方独自负责抚养，另一方支付一定的抚养费用。
对于财产分配，双方应该先进行详细清单和评估，包括夫妻共同财产和个人财产。然后根据实际情况和贡献程度，协商出一个合理的分配方案，尽可能保证公平公正，不损害双方的权益。
对于债务承担，双方也应该先进行详细清单和评估，包括夫妻共同债务和个人债务。然后根据实际情况和承担能力，协商出一个合理的承担方案，尽可能保证公平公正，不增加双方的经济负担。
最后，双方应该将协议书正式起草并签署，以确保离婚协议的有效性，并避免出现纠纷和法律风险。在起草和签署协议书的过程中，可以寻求专业律师或法律援助部门的帮助和指导，以保障自己的权益和避免风险。
总之，孩子三个月离婚是一件非常严肃和复杂的事情，双方应该以平等、真诚和善意的态度，尽量达成协议，减少对孩子和家庭的伤害。
