离婚后的父子协议生效的问题，应该由双方达成的协议内容以及协议的法律地位来决定。首先，协议必须是合法有效的，符合我国法律法规的规定，否则不论是否离婚均无效。
其次，协议的内容应该包括双方在子女抚养、教育、财产分配等方面的约定，如定期探视、赡养费用的支付、财产分配的比例等。此外，协议还应该注明父母双方对子女的监护情况，以及发生纠纷时的解决方式。
针对父子协议的法律地位，我国婚姻法对此进行了规定。婚姻法第五十一条规定：“离婚后，父母双方应当共同行使对未成年子女的抚养、教育、监护等权利和义务。如不能共同行使，由有关部门根据未成年子女的利益，规定一方行使，另一方给予赡养费用。”因此，如果离婚后的父子协议与婚姻法相悖，婚姻法的规定将会优先受到执行。
综上，离婚后的父子协议必须符合我国法律法规的规定，并注明了双方在子女抚养、教育、财产分配等方面的约定及纠纷解决方式，才能生效。同时，婚姻法对离婚后父母双方行使抚养、教育、监护权的权利和义务作了规定，协议中相反的约定会被婚姻法所取代。
