农村协议离婚房产过户是指在农村地区，夫妻在离婚协议中达成一致，将共同持有的房产过户给一方或划分给双方各持有一部分。具体流程如下：
1.拟定离婚协议：夫妻双方应当制定一份离婚协议，详细说明房产分配方案，以便日后签署协议时依据。
2.办理财产公证：在正式离婚前，可以办理财产公证，公证员将夫妻双方的协议予以记录、证明，免去日后的麻烦。
3.办理过户手续：离婚协议签订后，应当前往当地房产管理部门办理房屋过户手续。如果只有一方继续持有，需要提供协议、身份证、房产证等证明材料，经过审批后可以办理过户。如果是划分后各自持有，那么需要进行拆分手续，拆分后每方需单独申请过户。
总之，在农村协议离婚房产过户时，需要多方面准备，亲自跑一趟房管所，自己办理过户手续，保证过程顺利完成。同时，如果无法协商达成一致，还可以考虑通过法律途径解决。
