长期分居是指夫妻双方因某种原因，如工作、学习、家庭关系等造成居住地点不同，长期未同居的情况。这种情况下，如果双方达成了一致的协议，就可以办理离婚手续。
首先，需要明确的是，因为夫妻双方长期分居，已经导致了婚姻关系的破裂，协议离婚是解决矛盾的较好方式。协议离婚需要夫妻双方自愿并且没有障碍，双方应该保持平等协商，沟通达成离婚协议。因此，在离婚协议中，双方应该明确将财产如何处理，子女如何抚养等问题，以避免日后出现矛盾。只有双方达成了协议，才能顺利进行离婚手续。
协议离婚可以缩短离婚时间和手续，同时也可以减少夫妻之间的矛盾和纷争。但也需要注意的是，离婚并不是解决问题的唯一方式。如果夫妻双方之间的矛盾不是很大，可以考虑共同解决问题，重新修复婚姻。如果夫妻之间还存在感情，长期分居后也有可能复合。因此，在决定离婚之前，应该认真思考并与家人、朋友、律师等人进行沟通，以选择最适合自己的方式。
