如果已经提交了离婚协议，但是需要进行修改的话，需要进行以下步骤：
1.与对方协商：首先需要与离婚对方进行协商，与他们沟通需要进行哪些修改，讨论改动方案以达成共识。
2.书面提出修改要求：根据需要修改的内容，需要在书面上提出修改要求，具体列出需要修改的内容、修改后的内容以及修改的原因，例如房产分割、子女抚养等。
3.重新起草协议：根据新的修改要求，需要重新起草协议，列出双方同意的新条款，确保内容合法、合规。
4.再次协商并签字：新的协议需要再次与对方进行协商，确认修改内容无误，并与其签字确认。
总结来说，如果已经提交了离婚协议，但是需要修改的话，需要与对方协商并书面提出修改要求。根据需要修改的内容重新起草协议，进行再次协商并签字确认。需要注意的是，修改后的协议需要遵守法律规定，并能被法院认可。
