违建协议拆迁是一种以和解方式解决城市建设和拆迁中的争议和纠纷的法律手段。这种合法性主要与以下三个方面有关。
一、合法性基于政策法规的指导原则
中国的城市规划、征地拆迁以及土地管理等政策法规对违建的处置和拆除，早已有明确规定，以确保公共利益和人民利益的最大化。这些法规的指导原则，明确要求对于违反城市规划、土地管理等法规，建造没有经过审批许可的建筑物，政府应当依照法律规定予以拆除。因此，政府对违法建筑的追究和惩罚，以及与之相关的拆迁协议的签订和执行，是有法律和政策基础的。
二、合法性基于行政权力的行使
行政权力是国家机关在法律授权范围内，对社会关系直接作出管理处理的一种权力。而政府拆迁违建所具有的行政权力，是政府应有的职责和义务，也是国家对违法建筑行为的正常处理。在此过程中，需进行信息公开、协商、补偿等程序性操作，确保拆迁程序的公开透明和合理性。
三、合法性基于受害权益的保障
由于违建的存在，不但会对城市规划和建设产生负面影响，同时也会对周围居民的安全和生活造成极大的威胁。因此政府采取违建协议拆迁的方案，是为了保障行政和居民的权益，以确保公众的利益和安全。
总之，合法性是违建协议拆迁存在的前提，政府应当依法依规行使行政权利，拆除违规建筑、规范城市建设，这是保障公共利益、促进城市发展的必要措施。
