离婚协议是离婚双方达成一致意见后的书面协议，其具有法律效力。在协议中约定居住权未登记是否有效，需要根据离婚双方的具体情况来看。
首先，需要明确的是，如果夫妻双方共同所有的房产是婚姻财产，离婚后如果居住权未经过法律手续进行登记，仍然不能改变同等共有的权利，即仍然具有同等的权利。这种情况下，离婚协议约定的居住权未登记可能不具有法律效力。
如果离婚双方自己各有一处房产，那么离婚协议中约定居住权未登记可能具有一定的法律效力。因为，遵照《婚姻法》的规定，双方个人财产应该自主管理，双方有权自行决定房产的使用权。但要注意的是，如果在双方签署离婚协议之后，居住权方发生意外故障或出现争端，未经过法律手续登记，关于居住权的处理可能会受到一定的影响。
最后，建议离婚双方在签署协议前咨询专业的律师，了解自己在婚姻财产和房产方面的权利和义务，明确自己的权益和责任，以便更好地达成协议，并保障自己的合法权利。
