农村宅基地有房产证是很常见的情况。但是，如果你持有农村宅基地房产证，需要核实是否属于合法拥有，由此产生的问题主要有以下几种：
首先，是房子的产权问题。如果宅基地上的房子存在争议和瑕疵，可能会引起产权纠纷。这时，你需要调查当初房产证的产权来源和属于谁，土地性质和使用权归属等问题。
其次，是土地的使用权问题。宅基地的所有权和土地使用权是分开的，需要按照规定进行审批和登记。如果宅基地已经有了房产证，就需要了解户口迁移、房屋评估价值以及税额计算等问题。
最后，是宅基地的合法性问题。农村宅基地一般是按照村委会的规定授予给农民的。但是，如果该宅基地并非村委会授权给你，而是由其他渠道获取，这时宅基地的使用权和产权就十分复杂和棘手。
在解决这些问题时，需要透彻了解宅基地政策，规划和持有土地的用途，遵守宅基地和土地使用的相关法律法规，加强自我规划和管理，以确保农村宅基地使用权的合法性和权益的保障。
