首先，需要强调的是，离婚协议书是离婚程序中的重要文件，应该在双方通过协商达成一致后，由专业律师指导撰写，确保合法合规。以下是一般情况下分居两年离婚协议书需要包含的内容：
1. 协议双方的身份信息、结婚日期、子女信息等基本信息。
2. 离婚协议选择的方式： 可以选择协议离婚、诉讼离婚等离婚方式，根据情况选择最适合自己的方式。
3. 离婚财产分割：对夫妻共同财产进行公平分配，协商好房产、车辆、存款、投资等财产的归属。需要注意的是，如果有房产、土地等不动产，还需要办理产权变更手续。
4. 子女抚养和探视：制定双方对未成年子女的抚养、教育、监护和探视安排，确保子女的权益得到保障，缩小离婚对子女带来的影响。
5. 负担债务的责任：确定双方在婚姻期间的债务共同承担，以及在离婚后的还款责任。
6. 离婚后的姓名变更：对夫妻双方是否需要或愿意恢复原姓名，以及如何操作需要进行协商。
7. 离婚协议的生效情况： 离婚协议经过双方签字确认，依法生效。
在分居两年后，离婚可能暴露出很多问题，受到很多不利因素的影响，因此，协商和签订离婚协议不仅能够解决各种纷争，还有助于避免事后产生的矛盾和不必要的麻烦。
