农村宅基地房产证的办理一般由当地的县、镇、村、乡政府负责，其中县级政府为最终审核机构。其具体办理流程如下：
1. 首先，业主需要提供宅基地土地证、土地权属证明、房屋建筑图纸等相关材料，并缴纳相关手续费。
2. 村级政府会安排专门的工作人员进行现场核查，并进行公示，听取群众意见。
3. 村级政府审核通过后，将申请材料和审核意见移交至乡级政府审批。
4. 在乡级政府审批通过后，将材料和审核意见移交至县级政府审核。
5. 若县级政府审核通过，颁发宅基地房产证书，并交由登记机关进行登记。业主收到宅基地房产证后，即可享受到房屋产权的权利，并依法缴纳相关的房地产税、土地增值税等税收。
总之，农村宅基地房产证的办理流程需要严格遵守国家法律法规，确保审核程序公平公正，以保障公民的合法权益。
