如果拆迁协议的原件丢失或损坏，应及时联系签订方或相关部门，尽可能地寻找相关证据以证明协议内容。如果无法找到签署方或相关部门，可以通过法律途径来处理。
首先，可以委托律师或法律服务机构进行调查，以确定协议内容和签署方，并尝试获取复印件或电子文档，以便可以作为证据提交给法院或调解机构。
其次，如果存在其他证据可以证明协议的存在和内容，也可以通过调查和比对证明文件的真实性和准确性。例如，可以通过查询不动产权籍或产权证明，或者通过询问邻居或社区居委会来获得相关信息。
最后，如果以上方法都无法解决问题，则需要通过法律途径来处理。可以向法院申请解除拆迁协议的效力，或者请求法院进行重新制定协议，以确保利益受到保护。
在任何情况下，重要的是要及时处理，保护自己的合法权益，避免进一步损失。
