平潭协议离婚是指在台湾和福建平潭综合实验区两地婚姻中，双方达成协议最后离婚所进行的一种方式，也是目前两岸离婚中较为常见的方式。针对这种离婚，当事人可以在两地进行办理，具体流程如下：
一、在台湾地区办理离婚
1、前往户政事务所进行登记：离婚双方需前往户政事务所，提供相关证明材料，进行离婚登记。
2、进行协议签署：离婚双方需在户政事务所签署离婚协议书，并提交给该机关备案。
3、缴纳离婚登记费用：离婚双方需缴纳离婚登记费用。
二、在福建平潭综合实验区办理离婚
1、前往当地婚姻登记机关申请离婚：离婚双方需前往当地婚姻登记机关申请离婚。
2、进行协议签署：离婚双方需在婚姻登记机关签署离婚协议书，并提交给该机关备案。
3、缴纳离婚登记费用：离婚双方需缴纳离婚登记费用。
以上是关于平潭协议离婚的办理流程介绍，需要注意的是，无论是在台湾还是福建平潭综合实验区办理离婚，均需要双方自愿离婚，达成协议，并进行相关手续的办理。同时，双方需要注意自身利益问题，如涉及到财产分配、子女抚养等问题，应当及时咨询律师，以免其权益受到损害。
