分居协议是在婚姻关系破裂、但双方尚未决定离婚时，为了解决分居后的财产分配和子女抚养等问题所签订的协议书。根据《婚姻法》规定，夫妻分居半年以上的，可以申请离婚。在分居期间，如果双方已经签订了分居协议，那么该协议的有效期要根据双方当时签订的协议内容来确定。
一般来说，分居协议一般都是针对分居期间的财产分配、子女抚养、探视等作出规定，如果协议内容没有规定期限，那么就要看协议是否存在明显的不公正或违反法律规定的情况，否则可以长期有效。但如果离婚时，原协议内容与法定离婚协议书规定有明显不一致的情况，以离婚协议书规定为准。
当然，如果双方在签订分居协议的同时已经决定离婚，那么分居协议的效力就会被离婚协议所取代，离婚协议书的有效时间一般为6个月，这是为了避免因离婚协议时间太长而给一方带来损失。
总之，分居协议离婚多久有效，要具体根据协议内容来判断，同时要严格遵守相关法律规定。达成分居协议后，双方要坚持履行协议内容，避免引发不必要的纠纷，保障自身合法权益。
