在协议离婚中，夫妻双方一般会就财产分配达成协议，包括房产证的归属。如果双方一致同意，房产证的办理流程相对比较简单，但如果分配不一致，房产证的处理就会变得复杂，并可能需要法院介入。
如果夫妻双方一致同意判决离婚，并明确约定一方配偶放弃对房产的所有权，另一方配偶独立享有房产的所有权，此时应该尽快办理房产产权变更，确定所有人的产权。这时，房产证的办理流程如下：
1.办理房产转移登记：独立享有房产权的一方需要携带受理离婚的判决书和双方签署的协议书，申请向房产所在地的不动产登记机构办理房产转移登记。
2.获得新的房产证：经过登记机构核实后，原有的房产证会被注销，新的房产证会发给独立享有房产权的一方。
如果夫妻双方无法就产权分配达成一致，则需要请律师助理，向法院提起诉讼，要求对产权进行分割。如果法院认为双方协议不合理，也有可能要求重新协商，直至达成协议。
协议离婚中的房产证如何办理，需要根据实际情况进行处理，如果双方协商一致，房产证的办理流程比较简单。如果双方无法协商，需要通过法律途径解决争议，需要注意相关的政策和法规。
