要办理结婚三年协议离婚，需要按照以下步骤进行：
1. 协议离婚协议的签订：离婚双方必须在离婚协议书中协商好离婚财产分割、子女抚养、探视等有关事项，签署离婚协议书。
2. 提交离婚申请：离婚双方需要前往当地人民法院或司法局办理离婚登记手续，提交离婚申请，提供所需材料，包括离婚协议书、身份证、结婚证等。
3. 审核离婚材料：当地人民法院或司法局会对双方提交的离婚申请材料进行审核，确保离婚符合法律规定，并将审核结果告知申请人。
4. 离婚登记：审核通过后，当地人民法院或司法局会进行离婚登记，正式颁发离婚证书。
需要注意的是，离婚涉及财产分割、子女抚养和探视等问题，离婚双方必须按照协议书中的约定履行义务，否则将面临法律制裁。此外，在离婚过程中，应当理性对待感情问题，尽可能平和协商，不要过于情绪化，以免影响你的离婚进程。
