澳门协议离婚是指采用澳门特别行政区法律程序，由辖区法院根据当事人的申请判决双方离婚的程序。在澳门地区，离婚分为与共识离婚和争议离婚两种。
对于女方而言，协议离婚不一定要分居。根据澳门特别行政区的离婚法规，离婚的情况是多种多样的，不同情况下的离婚还需要满足不同的条件。
在共识离婚的情况下，双方既可以达成离婚协议，也可以通过调解达成离婚协议，这种情况下不需要分居。双方只需就离婚协议的具体内容达成一致并签署离婚协议书即可。
而在争议离婚的情况下，离婚的事实或原因是不能由一方单方面证实的，需要通过法院审理解决。这种情况下，如果一方要求分居，则法院可能会根据情况的不同做出分居或者不分居的裁决。
总之，女方是否需要分居取决于具体的情况，如果双方能够达成共识离婚意见，就可以不要分居。如果是争议离婚，女方要根据情况决定是否要分居。无论什么情况下，建议女方在决定离婚前仔细咨询律师，了解自己权利和义务，以便做出最好的决定。
