个人协议在拆迁时并不一定有效。拆迁是一项涉及政府、房主、开发商等多个主体的复杂社会事务，其中的利益关系极为复杂。在这个过程中，只靠个人协议来达成共识，显然并不可靠。而且，即使双方在合同上签订了协议，如果合同与国家法律法规或者相关规定不一致，那么这份协议也是不合法的。因此，对于拆迁中的争议和矛盾，应该通过法律手段来解决。
此外，即使签订了个人协议，也存在一些风险。例如，开发商可能会利用信息不对称，迫使房主签订不公平的协议，导致房主受到经济损失；或者开发商根本不履行协议，房主也拿不出有力的证据来维权。
因此，为了保障拆迁权益，房主在拆迁时应该与政府、开发商等主体建立正式的合作关系，通过合法途径保护自己的合法权益。在签订合同时，房主应该清楚了解合同的具体内容，确定合同是否符合法律规定，一旦发现合同存在问题，及时向相关部门和律师寻求帮助，以保护自己的合法权益。综上所述，虽然个人协议在某些情况下能够起到一定的作用，但是在拆迁过程中应该尽量通过法律手段来解决，确保自身的权益不受侵害。
