拆迁协议在我国实行的时候，因为还不完美，存在一些问题，例如有些协议没有征得业主的同意等问题，因此存在一定的非法性。但自2007年开始，政府在拆迁时开始重视民主群众的参与，逐渐规范拆迁程序，进行拆迁补偿等方面的完善，使得相对来说拆迁协议的合法性提高了许多。
尽管如此，拆迁协议在实际操作中仍然存在一些问题和不足。其中一个主要问题就是协议的签订过程存在着愚弄和强制的可能，很多民众不知道自己的权利和拆迁补偿标准等信息，而政府又常常不愿意与民众作积极的沟通和解释。在这种情况下，一些开发商或政府官员会利用民众的无知和软弱之处签订违法的拆迁协议。
此外，还有一些拆迁协议在执行过程中遇到了财政资金短缺、开发商资金缺乏、收购坚持不卖房屋等问题，导致拆迁协议未能按照承诺实现。这些情况下，就需要监督部门和法律进行干预和调整，以维护民众的合法权益和社会的和谐稳定。
总之，在拆迁协议的签订和执行中，政府和企业应该建立合法、公正、透明、公开的协商机制，充分尊重和保护民众的权益，防止造成负面影响，最终形成一个和谐、稳定、可持续的社会发展环境。
